マイカー通勤で事故などに巻き込まれて遅刻した場合、どのように対処すればいいですか？

誠実勤務義務という点を考えれば、業務開始時間には業務が始められるように時間的余裕を持って出社すべきです。

そのため、渋滞等を見越して余裕を持って家を出るべきであり、基本的には自然渋滞や交通事故による遅刻は認めないというスタンスでよろしいかと存じます。

自然渋滞や交通事故であっても、その回数が多い場合は、それは単に家を出る時間が遅いだけということになります。

ただし、電車通勤の方との公平性の観点からも、本人に責に依らない（どうしても回避することができない）大きな事故や道路工事等で、予測できない渋滞で遅刻した場合は、速やかに会社に連絡をするとともに、事故現場や渋滞している写真を携帯電話で撮影させるなどを条件として例外的に認めるという余地も残しておいてもよろしいかと存じます。社内で話し合って可能であれば運用ルールとして確立してください。

気を付けるべき点としては、運転中の携帯電話の操作は道路交通法に違反しますので、会社等へ連絡する際は「車を安全な場所に止めてから」という点は遵守させるようにしてください。