管理職は、残業対象では無いと契約内容を見直すことはできますか？（人事労務Q&A）

ご留意いただきたい点としては、「管理職（社内の職位）＝管理監督者（労基法上）」では必ずしも無いという事です。

管理職というのは、各会社ごとの制度や規定により任命する職位であり、定義は各社に委ねられています。一方、労基法上の管理監督者とは概ね以下のような要件が求められます。

(1)経営者と一体的な立場で仕事をしている
(2)出社・退社や勤務時間について厳格な制限を受けていない
(3)その地位にふさわしい待遇がなされている

お尋ねの契約社員の営業所長の残業代の扱いについてですが、(2)の要件は満たしているようですが、(1)と(3)についてはいかがでしょうか？もし満たしているのでしたら、労基法上の管理監督者として残業対象外への契約変更も可能です。しかし、一般的に上記の3要件に照合すると、労基法上の管理監督者として認められない可能性が大きいように存じます。よって、これまで通り残業対象とし、一方、残業時間について自由にしておくのではなく、必要に応じて管理・指導されるのがよろしかと思います。